En plena época de los samurái, los alienígenas (conocidos como Amanto) invadieron Japón y, pese a la resistencia de varios fieros guerreros Joui, consiguieron tomar el país, llevando a Edo hasta una etapa de esplendor medio futurista. En medio de todo esto está Gintoki, samurái que luchó en la guerra contra los Amanto, pero que ahora se dedica a hacer cualquier trabajo que se le encargue en la Yorozuya, su oficina de chico para todo.
La academia Baramon es la preparatoria de sólo chicos más prestigiosa de la región. Es allí donde el protagonista, un chico nuevo en la escuela, conocerá a muchos hombres poderosos y valientes. Tenemos al maestro rebelde, al capitán del equipo de fútbol, al amigo de la infancia… amor, amistad, conflictos… todo sucediendole a nuestros protagonista. Esto es una historia de amor escolar que te despertará emociones inesperadas.
La humanidad lleva años enfrentándose a los kaiju, monstruos gigantescos, pero esa época llega ahora a su fin. Con la Tierra en una era de paz, comienzan a aparecer chicas que poseen el alma de los míticos kaiju de antaño y que tienen la capacidad de usar sus poderes: son la Kaiju Girls. Sigan la vida de estas lindas, poderosas, y en ocasiones despistadas chicas.